বর্তমানে সইফ আলি খানের স্ত্রী করিনা কাপুর। করিনার আগে সইফ বিয়ে করেছিল অমৃতা সিং কে। যিনি তার থেকে ১২ বছরের বড়। তাদের দুজনের এই বিয়ে দেশজুড়ে অনেক আলোচনা হয়েছিল। কিন্তু শেষপর্যন্ত বিয়েটা টেকেনি। ১৭ বছর পর বাবা সইফ আলি খান ও মা অমৃতা সিংয়ের সম্পর্ক নিয়ে মুখ খুললেন তাঁদের প্রথম সন্তান, নায়িকা সারা আলি খান। ১৭ বছর পর বাবা সইফ আলি খান ও মা অমৃতা সিংয়ের সম্পর্ক নিয়ে মুখ খুললেন তাঁদের প্রথম সন্তান, নায়িকা সারা আলি খান। তাঁদের সম্পর্কে অনেকরকম সমস্যা দেখা দিয়েছিল, তাঁরা সুখী ছিলেন না। তাই বিবাহ বিচ্ছেদটাই সেরা সিদ্ধান্ত ছিল বলে জানিয়েছেন সইফ কন্যা। তিনি বলেন, আসলে আমাদের হাতে দুটো অপশন থাকে। এক হল, অসুখী হয়েও একই সঙ্গে চুপচাপ থাকা । আর দুই হল, সম্পর্ক তিক্ত হয়ে গেলে অন্য বাড়িতে দুজনে আলাদা থেকে সুখী থাকা। তা হলে একে অপরের প্রতি সম্মান বজায় থাকে। বাবা-মা সম্পর্কে সুখী ছিলেন না । তাই বিবাহবিচ্ছেদটাই সেরা সিদ্ধান্ত ছিল। মা যেমন আমার খুব ভাল বন্ধু, বাবাও তাই। যখন খুশি বাবাকে ফোন করতে পারি, তাঁর সঙ্গে গিয়ে থাকতে পারি। সময় কাটাতে পারি। ১৯৯১ সালে বয়সে ১২ বছরের বড় অমৃতা সিংকে বিয়ে করেছিলেন সইফ।পরিবারের কারও মত ছিল না এই বিয়েতে। ওই সময়ে এ ধরনের অসম বিয়ে দেশবাসীকে একটা নাড়া দিয়ে গিয়েছিল। সইফের বয়স তখন মাত্র ২১ বছর । আর অমৃতা সে সময় ৩৩-এ পা দিয়েছেন । ১৯৯৫ সালে জন্ম হয় তাঁদের মেয়ে সারার, ২০০১ সালে জন্ম হয় ছেলে ইব্রাহিম আলি খানের । কিন্তু এরপর থেকেই সইফ-অমৃতার সম্পর্কে ফাটল ধরতে শুরু করে। ২০০৪ সালে তাঁদের বিবাহবিচ্ছেদ হয়ে যায়। ২০১২ সালে করিনার সঙ্গে বিয়ে হয় সইফের। এখনও তাঁরা সুখে সংসার করছেন। সদ্যই তাঁদের দ্বিতীয় পুত্রসন্তান হয়েছে।